《寅次郎的故事48：寅次郎红之花》的剧情围绕主角寅次郎的生活展开。故事中，寅次郎的妹妹樱花长久未得到哥哥的消息，她决定在报纸上发布寻人启事，然而哥哥并非报纸的常客，所以一直未有音讯。

某天，樱花意外在电视报道中，看到哥哥阿寅作为神户大地震的志愿者出现，他率先喊出“老人优先”的口号，感动了无数观众。与此同时，阿泉决定与医生结婚，这让一直对她一往情深的满男难以接受，冲动之下，他破坏了婚礼，并来到偏远小镇寻找心灵的慰藉。

而阿寅在分别与十年未见的百合重逢后，得到了她的悉心照顾。两人携手回到寅屋，但阿寅在面对婚姻时，却显得犹豫不决，始终未能给这段感情一个圆满的结局。这部电影以真实细腻的笔触，展现了寅次郎面对生活挑战时的挣扎与成长。