《逆转奇兵第二季》剧情紧凑且扣人心弦。第二季开篇，爱国军团在战役中惨败，费城落入英方手中，华盛顿的队伍人心涣散，他本人也面临军队内部的叛徒和自己内心的挣扎。在这样的背景下，华盛顿将希望寄托在年轻的间谍组织库珀团身上，其中亚伯拉罕·伍胡作为灵魂人物，已经孤军深入到敌人战线背后。

剧中，华盛顿因内心道德冲突而患上急性忧郁症，他在是否要释放休利特以救已经暴露的亚伯之间徘徊不定。同时，亚伯在敌后继续以学习的名义观察海军动向，绘制情报准备传递出去。然而，他的行动被酒吧的酒保汤森察觉，汤森趁机将他的情报掉包。

此外，休利特在监狱中受到折磨，神经开始错乱，最终在西姆科的陷害下险些丧命。但在关键时刻，他趁乱逃跑，并继续为革命事业贡献力量。华盛顿在经历了一系列事件后，下定决心写信赦免休利特，但信件却被西姆科截获，引发了一系列新的危机。